Probiotikler ve prebiotikler zararlı mikroplarla yarışarak bunların kolonize olmasını , çoğalmasını engeller. Bunların vaginal mantar enfeksiyonlarında ( candidiasis) kullanımı aynı esasa dayanır. Antibiotik kullanımı, kortizon , IL 17 blokerleri ( sekunumab ) tedavisi mantar enfeksiyonlarını arttırabilir. Bunun yanısıra östrojen de içeren kombine doğum kontrol haplarının kullanımı mantarı arttırabilir. Östrojen vaginada glikojen miktarını arttırarak buna yol açar.
Probiotikler özellikle L.acidophilus candida albikans mantarının film tabaka yapmasını önler. Bu laktobasiller besin kaynağı için mantarla yarışırlar ve bu yolla faydalı olurlar.
Probiotiklerin akut ve tekrarlayan enfeksiyonlarda davranışları farklı olabilir.
Akut mantar enfeksiyonunda lactobasillus acidophilus , L .rhamnosus,Stereptokokus thermofilus ,laktobasillus delbrueckii ve L, bulgaricus kullanımı klinik rahatlama sağlar. Yine laktobasillus plantarum kullanımı aynı anda kullanılan flukanazol tedavisinde faydalı olmuştur.
Tekrarlayan mantar enfeksiyonlarında flukanazol verilmiş ardından 5 gün vaginal probiotik hergün , ardından 10 hafta haftada bir probiotik verilmiş ve olumlu yanıt alınmış. Bazen probiotik tedavisi 4-6 ay kullanılmış ve faydalı bulunmuştur. Ancak genel olarak tekrar eden mantar enfeksiyonlarında probiotiklerin kullanımı ile kesin bir başarı söz konusu olmamıştır.
Antibitik kullanımı ile oluşan mantar enfeksiyonunda probiotiklerin yararı sorgulanmalıdır.