Bazı durumlarda vajinal muayenenin yapılması zorunlu olabilir. Plansız bir gebelik oluşması durumunda ve son yıllarda hiç smear testi yapılmadı ise ilk muayenede smear testinin yapılması faydalıdır. Böylece muhtemel bir enfeksiyon veya anormallik erkenden saptanır.
Zaman zaman gebelikte vajinal kanama görülebilir. Bu kanama çoğunlukla gebelikle ilgilidir.Ancak bazen de vajinal muayene sonucu bu kanamanın rahim ağzındaki yaradan veya polipten kaynaklı olduğu saptanır. Tedavi şekli çok farklı olacaktır.
Bunun yanısıra gebeliğin ilk döneminde vajinal ultrason ile fetüsün durumu hakkında çok net bilgiler edinilir. Örneğin karından yapılan erken dönem ultrasonda fetüsün kalp atımı görülemezken,vajinal ultrason ile 5. haftadan itibaren fetüsün kalp atımı saptanabilir.
Düşük tehdidinden emin olabilmek için,gebeliğin rahim içine mi dışına mı yerleştiğini saptamak için vajinal yolla ultrason yapmak gerekmektedir.Ultrason sadece rahim ağzına ulaşıp daha kapsamlı görüntü almamızı sağlar,ancak bebekle temas etmez.Dolayısı ile zararlı değildir.