Gebeliğin selameti açısından sağlıklı vajinal ortam çok önemlidir. Sağlıklı olan vajende laktobasil hakimiyetidir. Bunlar hidrojen peroksit ve bakteriosin gibi antimikrobial ajanlar oluşturur ve vajinayı korurlar. Aynı zamanda laktik asit oluşumu ile ve de immun modülasyon yaparak vajen sağlığını oluştururlar. Laktobasil azalınca bakterial vaginosis ve grup b streptokok kolonize olarak gebelik üzerine olumsuz etki yapar. Bakteriel vajinosis erken doğum, prematür membrane yırtılması, erkenden suların gelmesine düşük olmasına ve korioamnioite neden olabilir. Annede vajinal enfeksiyon % 30-50 erken doğumla sonlanır. Sadece metranidazol den ziyade laktobaillus rhamnosus GR-1 ve laktobasillus reuteri RC-14 kullanımı kür oranını çok arttırır. Grup B streptokok sağlıklı bir kadında sindirim sistemi ve genitoüriner yolda % 30 oranında bulunur. Maternal grup B streptokok tutulumu genellikle asemptomatik olur ancak gebelerde endometritis, koryoamniotis, bakteriemi, hatta ölü doğumlara yol açabilir.Laktobasiller bu kolonizasyonu önler.